Dilatar belakangi hal itu klasifikasi pesantren menjadi berubah. Dulu, mungkin kita mengenal satu buah pesantren, pesantren dengan sistem salaf. Pesantren yang memiliki menejemen dan administrasi pesantren yang sangat sederhana, dengan sistem pengelolaan pesantren berpusat pada aturan kyiai yang diterjemahkan oleh pengurus pesantren. Tercatat sekitar 8.905 pesantren salaf ada di Indonesia.